表題の件。
PhpStormでPHPCSを使う場合、プロジェクトごとの除外ルールなどを適用させるやり方。
結論は「プロパティ > Editor > Inspections > PHP > PP Code Sniffer Validatin」を辿り、右下の「Coding Standard」からCustomを選択。
「Path to ruleset」でプロジェクトごとのルールセットのxmlを指定する。
ちなみにphpcs.ruleset.xmlという名前のファイルでWordPress用で中身はこんな感じです。
<?xml version="1.0"?>
<ruleset name="WordPress Theme Coding Standards">
<!-- See https://github.com/squizlabs/PHP_CodeSniffer/wiki/Annotated-ruleset.xml -->
<!-- See https://github.com/WordPress-Coding-Standards/WordPress-Coding-Standards/blob/develop/WordPress-Core/ruleset.xml -->
<!-- Set a description for this ruleset. -->
<description>A custom set of code standard rules to check for WordPress themes.</description>
<!-- Include the WordPress ruleset, with exclusions. -->
<rule ref="WordPress">
<!-- 固定ページ内にクラスを入れることを許容 -->
<exclude name="WordPress.Files.FileName.InvalidClassFileName" />
<!-- ファイル名の決定時にslugをサポートするため、page-hoge_fuga.php を許容する -->
<exclude name="WordPress.Files.FileName.NotHyphenatedLowercase" />
<!-- コメント分の末尾をフルストップ、ビックリマークやはてなで終わらせる必要があるルールを除外する -->
<exclude name="Squiz.Commenting.InlineComment.InvalidEndChar" />
<!-- _sのテーマに元々ある多言語化周りの警告を無視する -->
<exclude name="WordPress.WP.I18n.MissingTranslatorsComment" />
</rule>
<exclude-pattern>*/vendor/*</exclude-pattern>
</ruleset>
実行は下記の通り。
$ ./vendor/bin/phpcs -p -s -v -n --standard=phpcs.ruleset.xml --extensions=php themes/my-theme/